Excision de l'intron par formation d'un lasso : vue d'ensemble du mécanisme. L'excision-épissage est réalisée par réaction d'un nucléotide à adénine (A) situé dans l'intron avec un nucléotide à guanine situé en 5' de l'intron. Cela entraîne la séparation de l'intron d'avec l'exon 1 (situé en amont) et la formation d'une structure en lasso interne à l'intron. Ensuite, l'extrémité 3' de l'exon 1 réagit avec l'extrémité 5' de l'exon 2 permettant l'épissage des deux exons et la libération du lasso qui sera dégradé par des ribonucléases.

Excision de l'intron par formation d'un lasso : le splicéosome. Le splicéosome fait appel à des facteurs spécifiques : ribonucléoprotéines contenant des petits ARN(snRNP), ribozymes (ARN ayant des propriétés catalytiques), des enzymes spécifiques (maturases)... La structure secondaire du transcrit I met en contact trois séquences de l'intron : la séquence du début de l'intron (extrémité 5'-GU ou site donneur), la séquence de la fin de l'intron (extrémité 3'-AG ou site accepteur) et un nucléotide à adénine (A du branchement) 40 nucléotides avant le site receveur.

Exemple d'épissage alternatif. A partir du même préARNm peuvent être obtenus deux ARNm matures différents codant pour deux isoformes de la troponine, une molécule impliquée dans la structure des myofibrilles (voir l'article "La contraction musculaire").

http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/transcription/transcription.htm

http://www.chups.jussieu.fr/polys/biochimie/BMbioch/POLY.Chp.4.17.html  

La TBP est la première protéine qui reconnait une séquence spécifique de l'ADN initiatrice de la transcription (la boite TATA).

Le facteur TFIIB semble impliqué dans la sélection précise du site d'initiation (nucléotide à partir duquel se déroule la transcription).

Le facteurs TFIIH comporte plusieurs activités enzymatiques dont une activité hélicase permettant l'ouverture de la double hélice d'ADN au niveau du promoteur, et une activité kinase responsable de la phosphorylation de la queue C-terminale de l'ARNpolymérase II. Cette phosphorylation entraîne une modification de la structure tridimentionnelle de l'ARNpolymérase entraînant la dissociation du complexe d'initiation et le début de la transcription.

TFII = Transcription Factor for RNApolymerase II (Facteurs généraux de la transcription pour l'ARN polymérase II);

TBP = TATA box-Binding Protein (Protéine de liaison à la boite TATA).

La régulation spécifique de la transcription.
Les enhancers (activateurs) sont des séquences situées parfois à plusieurs milliers de nucléotides d'un promoteur qui activent ce dernier par un jeu d'interactions protéiques qui stabilisent le complexe d'initiation. Ces interactions sont rendues possibles par la courbure de l'ADN qui rapproche des éléments situés à de grandes distances les uns de autres.Cette activation est spécifique du gène et utilise une multitude de facteurs de transcriptions spécifiques (les protéines activatrices) qui agissent généralement sous forme dimérique).
Une répression spécifique peut agir selon le même type de modalité.

http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/transcription/transcription.htm

* L'initiation de la transcription sur un promoteur humain implique plusieurs facteurs de transcription, connus sous les noms de TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TFIIH et TFIIJ en plus de la RNA polymérase II elle-même.
* Au centre de ce mécanisme initial, il y a l'association de TBP, la sous-unité reconnaissant le DNA du facteur TFIID, avec la boîte TATA du promoteur. L'adjonction successive de TFIIB et de RAP30, petite sous-unité de TFIIF, sont ensuite nécessaires pour la fixation de la polymérase et déterminent à la fois le brin transcrit et le sens de la transcription. A ce complexe DNA-TFIID-TFIIB-RAP30-polymérase II, s'ajoutent encore successivement la grand sous-unité de TFIIF (RAP74), TFIIE et TFIIH. Alors la transcription peut commencer si les ribonucléosides substrats sont présents.
* Le complexe d'initiation de la transcription recouvre une séquence d'environ 100 nucléotides du brin antisens du DNA. TFIIH provoque l'ouverture et le déroulement partiel de la double hélice à cet endroit.
* La transcription commence à environ 22 nucléotides de la boîte TATA en direction opposée à celle des éléments GC-CAAT et se poursuit en remontant le brin antisens en direction de son extrémité 5'.
* La formation de ce complexe est activée ou inhibée par les facteurs trans-régulateurs liés aux séquences cis-régulatrices du même promoteur. 

http://www.chups.jussieu.fr/polys/biochimie/BMbioch/POLY.Chp.4.12.html  

La transcription de l'ADN requiert une enzyme, l'ARN polymérase, et des facteurs généraux de transcription chargés de diriger l'ARN polymérase vers les gènes à transcrire. L'ARN polymérase III de la levure Saccharomyces cerevisiae possède 16 sous-unités dont 4 sous-unités spécifiques essentielles, C82, C53, C34 et C31 L'étude des relations entre les différentes sous-unités de l'ARN polymérase III a révélé une association entre C31, C34, et C82. Par ailleurs, il a été montré que la sous-unité C34 interagit avec la protéine TFIIIB70 appartenant au facteur d'initiation TFIIIB. Ces résultats suggèrent un rôle du sous-complexe C31, C34 et C82 dans le recrutement de l'ARN polymérase III par le complexe de préinitiation via la liaison de C34 avec TFIIIB70. Dans le but de vérifier cette hypothèse, une mutagénèse systématique de la sous-unité C34 a été réalisée et a permis d'obtenir des mutants affectés dans leur interaction avec la sous-unité TFIIIB70. Deux ARN polymérases III possédant une sous-unité C34 mutée ont été purifiées et testées en transcription in vitro. L'analyse biochimique de ces enzymes a révélé que la sous-unité spécifique C34 jouait un rôle non seulement dans le recrutement de l'enzyme mais également dans la formation du complexe ouvert. Les deux grandes sous-unités des ARN polymérases eucaryotes sont homologues aux sous-unités β' et β de l'enzyme bactérienne. Les régions conservées entre ces protéines ont permis de définir des domaines d'homologie. L'étude biochimique d'une ARN polymérase III altérée dans le domaine conservé f a montré que la mutation provoque un ralentissement du passage des sites de pause et une augmentation de la cinétique de clivage de l'extrémité 3' du transcrit naissant. Il semble donc que le domaine f intervient dans les mécanismes de translocation de l'enzyme et a une action, directe ou indirecte, sur le processus de clivage.

http://cat.inist.fr/%3FaModele%3DafficheN&cpsidt%3D184042

http://www.123bio.net/revues/ibouallaga/212.html  

La notion de gène chimère fait appel au fait que pour certaines protéines, on distingue clairement des domaines protéiques, communs dans de nombreuses protéines. Par exemple, un récepteur transmembranaire comme celui aux EGF comporte du côté intracellulaire un domaine tyrosine kinase, puis un domaine transmembranaire, et à l'extérieur de la cellule une succession de 3 domaines IG. On trouvera ailleurs dans le génome de nombreux récepteurs possédant un ou plusieurs de ces domaines : un domaine tyrosine kinase, plus de domaines IG, d'autres types de domaines extracellulaires, etc.
Une explication évolutive de la genèse des gènes codant ces protéines est de supposer que les fragments d'ADN codant ces différents domaines ont pu être remaniés par les mécanismes de l'évolution moléculaire. Par "bricolage", on peut imaginer combiner ainsi quelques motifs protéiques simples pour construire une multitude de protéines différentes. C'est ce type de gène, issu d'un tel "bricolage" de domaines protéiques que l'on nomme "gène chimère".

http://www.snv.jussieu.fr/vie/faq/1l/faq1l.htm  

* gène chimère marqueur de sélection : gène fabriqué à partir de morceaux de deux ou de plusieurs gènes différents et qui permet à la cellule hôte de survivre dans des conditions qui, autrement, entraîneraient sa mort.

http://fr.wikipedia.org/wiki/G%C3%A8ne  

Fabrication d'un gène chimère puis d'un OGM :

1. extraction du gène d'intérêt / enzymes de restriction
2. élimination du promoteur et terminateur
3. insersion d'un promoteur + terminateur reconnus par la cellule hôte + marqueur (résistance aux antibio)
4. insersion dans le plasmide d'E.coli
   
5. amplification / E.coli
   
6. insersion dans le génôme hôte (futur OGM) par canon à bille de Tg ou
   
7. séléction des OGM par culture sur antibiotique

La parthénogenèse est une reproduction sexuée uniparentale

La reproduction uniparentale est d'abord représentée par la reproduction asexuée, courante chez les végétaux, et existant chez certains animaux inférieurs comme les vers... ; cependant, certaines formes de reproduction sexuée, dégénérées relèvent de ce système : la parthénogenèse ou l'apogamie.