• TP1 phylogène / vertébrés

    TP : construction d'arbres phylogénétiques avec le logiciel phylogène

    téléchargement du logiciel phylogène : http://www.inrp.fr/Acces/biotic/evolut/phylogene/accueil.htm

    utiliser le logiciel phylogène : http://www.ac-nantes.fr:8080/peda/disc/svt/phylo/index.htm

    322 – Groupes phylogénétiques

    construire arbre vertébrés

    => état "primitif" (ou "ancestral") et "dérivé" ("évolué") d'un caractère

    un caractère ancestral, ou primitif ne permet pas de regrouper des êtres vivants puisque cet état de caractère peut être partagé avec d'autres êtres vivants d'un autre groupe, les êtres vivants ou fossiles qui partagent des états dérivés de caractères forment un ensemble appelé taxon, d'où le terme de taxonomie.

    schéma-bilan p35

    => groupe mono, para, polyphylétique

    établir une phylogénie revient à regrouper les espèces qui partagent les mêmes états dérivés pour un ensemble de caractères donnés. On classe les espèces dans des groupes phylogénétiques de plus en plus restreints. un groupe monophylétique (= clade => cladistique) est l'ensemble des espèces partageant un même état dérivé (= innovation évolutive). Plus des espèces partagent d'états dérivé, plus elles sont proches, plus leur ancêtre commun est récent.

    323 – Apport des données moléculaires

    arbre humain-chimp-grenouille-chauve souris

    les données moléculaire confirment les données macroscopiques : états dérivés => parenté => ancêtre commun.

    Plus deux espèces partagent d'états dérivés, ou plus leur degré de similitude moléculaire est important, plus elles sont proches et leur dernier ancêtre commun est récent.

    L'ancêtre commun à deux espèces présente les états dérivés de ses ascendants. Une partie de la population de ces ascendants possède des innovations génétiques qui sont transmises aux générations suivantes jusqu'à différentiation d'une nouvelle espèce.

    324 – Apport des données paléontologiques

    arbre tetrapodes

    ancêtre commun = espèce et non individu, entité hypothétique

    espèce fossile exprime des états dérivés, ce n'est donc pas un "chaînon manquant" ou un "ancêtre commun", on ne le place pas sur un noeud mais sur une branche de l'arbre phylogénétique.

     


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    établir une matrice taxons/caractères

  • classer la matrice

  • construire des groupes emboîtés

  • construire un arbre phylogénétique

  • matrice = tableau taxon / caractère faisant le bilan des observations

    taxon = groupe d'être vivants partageant des caractères communs

    arbre phylogénétique = tracé des relations de parenté entre taxons


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  • B1 : LA MORPHOGÉNÈSE VÉGÉTALE ET L'ÉTABLISSEMENT DU PHÉNOTYPE

     

    Observation de plantes à fleurs, dissection de fleur,

    Dossiers BDI

    B11,4 : Localisation des zones de croissance de la plante

    TP marquage zones de croissance plantules de soja au vernis à ongles

    résultats attendus p198 + 213

    http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/index12.html

    schéma des zones de croissance

    [meres = partie][auxim = augmentation]

    => la croissance végétale est localisée dans des territoires spécialisés de la plante : il existe des zones de croissance des extrémités (mérèse) et des zones de croissance de l'axe (auxèse) dans la tige et la racine d'un végétal.

    B1,2 : Morphogénèse par multiplication cellulaire

     

    § Quel est le mécanisme permettant la croissance par production de cellules ?

     

    B12,1 : Méristèmes, zones de multiplication cellulaire

    - Observation microscopique de méristèmes racinaires (p 200) et caulinaires et (p 203)

    http://interstices.info/upload/plantes/Fig3-1-grd-modif.jpg

    http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/index13.html

    http://fr.encarta.msn.com/media_461516454/Croissance_du_méristème_apical.html

    http://www-ijpb.versailles.inra.fr/fr/bc/equipes/Meristeme2/Fig1_Meristeme.html

    http://tpe.tournesol.free.fr/anatomie.htm

    http://interstices.info/jcms/c_10928/modeliser-le-vivant-creer-des-plantes-virtuelles-pour-comprendre-simuler-tester?portal=j_97&printView=true

    http://www.microscopie.ch/articles/solanum_germe/solanum_germe.php

    => Les méristèmes sont des zones de croissance par production de nouvelles cellules. Les cellules se multiplient par division. La division cellulaire, appelée mitose, permet de produire :

    - des cellules qui vont ensuite se différencier et participer à la croissance et à la structuration de l'organisme (morphogénèse : feuilles, tiges, racines) ;

    - des cellules qui restent indifférenciées et qui vont à leur tour constituer des méristèmes (caulinaire / racinaire, apical / axillaire).

     


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  • B1 : LA MORPHOGÉNÈSE VÉGÉTALE ET L'ÉTABLISSEMENT DU PHÉNOTYPE

     

    dessin d'une plantule de soja de 3-4 semaines

    La graine contenant l'embryon va germer et donner naissance au cotylédon puis à la racine puis au coléoptyle, le tout constituant alors la plantule

    dessin d'une plante

    L'appareil végétatif d'une plante, se distingue de l'appareil reproducteur, comprend : les racines (coiffe-poils) la tige (colet-noeuds-entre noeuds) les feuilles (pétiole-limbe-nervures) et les bourgeons (axilaire, apical).

    L'axe de la plante possède 2 extrémités : apex caulinaire et racinaire

    B11,3 : Comparaisons de morphologies végétales

    oldest trees in the world : http://www.wired.com/wiredscience/2010/03/old-tree-gallery/all/1

    diaporama sur la morphologie des végétaux : http://dnb35.ac-rennes.fr/pedagogie/svt/applic/veget/veget.htm ; http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/index11.html

    Le port désigne la morphologie de la partie aérienne du végétal : il peut être arborescent, buissonnant ou herbacé.

    bourgeons : http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/c14/c14a2p1.htm

    différents bourgeons de différentes espèces

    à des morphologies différentes correspondent des espèces différentes => cause génétique

    La classe sur le terrain : photos de deux chênes (Quercus) rencontrés lors de la sortie : http://svtr.blogg.org/date-2008-10-06-billet-876310.html

    différents chênes rencontrés lors de la sortie : ports arborescent ou buissonnant

    des morphologies différentes pour une seule espèce => causes environnementales

    bilan : La morphologie d'un végétal dépend en partie des caractéristiques génétiques de l'espèce. En fonction de leur environnement, des individus d'une même espèce peuvent avoir une morphologie différente.

    La Hulotte n°88 et : http://lahulotte.fr/expo_arbre_sommaire.php?osCsid=p90ab6o11ue019ujdf8eu4gm95

    exemples d'arbres « mangeurs de pancartes »

    Accommodation : apparition d'une morphologie nouvelle lorsqu'une plante est placée dans un milieu nouveau. La morphologie initiale réapparaît si la descendance est placée dans les conditions initiales. L'accommodation n'est pas génétique, elle a des causes environnementales.

    http://www.desert-tropicals.com/Plants/Cactaceae/Cactaceae.html ;

    Adaptation : acquisition au cours de l'évolution (temps en Ma) de caractères morphologiques particuliers transmis à la descendance. L'adaptation est donc génétique.

    http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/index11.html

    Des réponses morphologiques semblables peuvent être obtenues avec des végétaux d'espèces différentes placés dans un même environnement, on parle de convergence morphologique.

    gènes du riz et innondation : http://www.pourlascience.fr/ewb_pages/a/actualite-comment-le-riz-garde-la-tete-hors-de-l-eau-23213.php

    http://www.blogg.org/blog-50595-date-2009-09-15-billet-comment_le_riz_garde_la_tete_hors_de_l_eau-1082287.html#comments

     


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  • 3 - PARENTÉ ENTRE ÊTRES VIVANTS ACTUELS ET FOSSILES – PHYLOGENÈSE – ÉVOLUTION

    correction devoir

    Compléter schbilans©

    réflexion sur la classification, systématique, nomenclature, cladistique, taxonomie, …: qu'est-ce que, comment classer ?

    3,2 - L’établissement de phylogénies entre êtres vivants actuels ou fossiles

    321 – Matrice et arbre phylogénétique

    réflexion sur la classification, systématique, nomenclature, cladistique, taxonomie, …

    tableau de comparaison "cahier des charges de différentes classifications" d'aprés Lecointre :

    les termes : mammifère, poisson, ostéichthyen, reptile, invertébré, actinoptérygien, fruit, légume, batracien, amphibien, phytoplancton, bétail, nuisible, ...

    sont-ils tous pertinents dans les domaines : scientifique, culinaire, agricole, utilitaire, écologique, zoologique, …. ?

    => on ne définit pas un être par ce qu'il n'est pas mais par ce qu'il possède


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