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Bioooo2/ DU GÉNOTYPE AU PHÉNOTYPE, RELATIONS AVEC L’ENVIRONNEMENT

2312/ Les acides nucléiques, séquences de nucléotides

maquette ADN

manuel p.48

quelle est la forme d'une molécule d'ADN ?

forme des molécules et macromolécules / logiciel Rastop ou Rasmol : acides nucléiques : adn.pdb, arn.pdb

rappel TP 2ndes / logiciel adnarn : http://www.ac-amiens.fr/pedagogie/svt/info/logiciels/adnarn/index.htm

dessin et formule de l'ADN : http://www.futura-sciences.com/uploads/RTEmagicC_ARN-ADN-181208b.jpg.jpg

=> ADN = acide désoxyribonucléique, hélice bicaténaire, séquences de nucléotides, phosphate-désoxyribose-base ATGC ,

=> le gène porté par l'ADN est codé par la séquence des bases de la molécule

=> ARN = acide ribonucléique, plusieurs formes, monocaténaire, séquences de nucléotides, phosphate-ribose-base, Uracile

molécule

ADN

ARN

acide

phosphorique

sucre

désoxyribose

ribose

bases

Thymine+A+G+C

Uracile+A+G+C

nombre de brins

bicaténaire

monocaténaire

structure spatiale

double hélice

variable

types

un seul

ARN t, m, r, ni, mi, ...

Bases

Nucléoside = sucre + base

Nucléotide = sucre + base + phosphate

Adénine

adénosine

Adénosine monophosphate, AMP, ADP, ATP

Thymine

Thymidine

Thymidine monophosphate

Guanine

Guanidine

Guanidine monophosphate

Cytosine

Cytidine

 

Uracile

Uridine

 

 

sch'bilan

autres schémas-bilans :

http://www.ac-corse.fr/SVT/bonnet2.htm

http://perso.orange.fr/fguillonneau/these/Image9.gif

http://pages.usherbrooke.ca/bcm-514-bl/2d.html

http://perso.orange.fr/fguillonneau/these/fguillon.html#_Toc535654430

2313/ Une découverte historique : le code génétique

D synth prot

Quel est le rapport entre ADN et Protéines ?

TP séquences des protéines et des gènes des groupes sanguins / logiciel Anagène :

Charger des séquences : « cod.adn » = ADN, « .pro » = protéine : « acod.adn », bcod.adn » et ocod.adn » sont les allèles du gène des groupes sanguins

Comparer : combien de bases (nucléotides) en commun ? Différents ?

Convertir une séquence :

Que représente le brin transcrit de l'ADN ? non transcrit ?

Quelles différences avec L'ARN messager ?

Quelle correspondance entre ADN et polypeptide ?

pb : comment s'effectue un message à 20 lettres (protéine) à partir d'un message à 4 lettres (A.N.) ?

combien de bases faut-il associer pour avoir 20 combinaisons possibles ?

Calculez le nombre de combinaisons possibles en associants les bases (ATGC) pour les faire correspondre aux 20 acides aminés.

Le calcul des différentes possibilités montre qu'en associant 2 parmi les 4 nucléotides possibles le nombre de combinaisons est insuffisant puisque 42 = 16. Il faut donc associer 3 nucléotides pour faire 20 combinaisons possibles, mais comme 43 = 64, certaines combinaisons ne servent pas ou codent pour le même acide aminé que d'autres.

hypothèse : les nucléotides correspondent par triplets aux acides aminés

manuel p.50 : résultat des expériences de Nirenberg & Matthaei + tableau code génétique

animation code génétique : http://www.snv.jussieu.fr/vie/documents/codegenet/index.htm#anim

tableau code génétique : http://www.monde-solidaire.org/spip/IMG/jpg/UniversalGeneticCode.jpg

tableaux autrement : http://pst.chez-alice.fr/codgenet.htm

Nirenberg met in vitro de l'ARNm polyU (constitué uniquement d'Uridines), un extrait cellulaire et différents acides aminés. Il n'y a qu'avec de la phényalanine qu'il obtient un résultat : un polyPhe. Il fait la même expérience avec un polyC, polyA et polyG ; puis avec des séquences simples comme ACACACAC, AACAAC, etc ... C'est ainsi qu'en 1965 a été découvert le code génétique.

analogie : code Morse international, fait avec 2 signes : « ti » ou « ta » : http://www.lexilogos.com/clavier/morse.htm

La séquence des acides aminés des protéines est imposée par l'information génétique située dans la molécule d'ADN. Un gène est donc défini par la séquence d'un polynucléotide (ADN, ARN) déterminant la séquence d'un polypeptide. La séquence des acides aminés est gouvernée par celle des nucléotides suivant un système de correspondance, le code génétique. Chaque acide aminé correspond à un triplet de nucléotides appelé codon. Certains codons, dits redondants, correspondent au même acide aminé. Il existe des codons dits "d'initiation", d'autres de "terminaison". Le code génétique est identique pour toutes les espèces vivantes connues : il est universel et dégénéré (le doublet initial peut être seul déterminant, la nature dégénérée du code a pour conséquence sa redondance).

Evaluation formative : http://learn.genetics.utah.edu/units/basics/transcribe/ (attention : pas de différenciation codon/anticodon)

  • Le phénotype moléculaire correspond à une protéine, permettant l'expression d'un caractère héréditaire.

  • Le programme génétique est porté par l'ADN, support du génotype.

Quel est donc le lien entre ADN, support des gènes, et protéine, expression des gènes ?

 

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