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Bioooo2/ DU GÉNOTYPE AU PHÉNOTYPE, RELATIONS AVEC L’ENVIRONNEMENT

 

Les enzymes sont des protéines : qu'est-ce qu'une protéine ?

2,3/ La synthèse des protéines

231/ Des macromolécules séquencées
2312/ Les protéines, séquence d'acides aminés

éléctrophorèse des protéines du blanc d'oeuf (manuel p.78) : http://www.didier-pol.net/2elec-pr2.htm

electrophorese : http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/doc_biochemistry-electrophoresis.htm

séparation des acides aminés par chromatographie d'une protéine hydrolysée par protéase : http://www.didier-pol.net/2FTCCMAA.html

formule chimique des acides aminés puis de la liaison peptidique : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/acideamine/acideamine.htm

modélisation des acides aminés puis de la liaison peptidique

les protéines, phénotype moléculaire, sont formées d'acides aminés, reliés par liaison peptidique. Les protéines sont des polymères d'acides aminés, donc des polypeptides, formant une séquence d'acides aminés. Il existe 20 acides aminés différents.

Alors y'é réprend la molécoule vue avec les enzymes, une enzyme donc :

modélisations carboxypeptidase : fichiers Rastop : CPA.PDB et CPA-SUB.PDB (site actif)

forme globale : Ruban -> hélices et feuillets

avec plugin Chime : http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/chimdata/scripts/cpa/cadr_cpa.htm

http://www.ac-poitiers.fr/svt/activite/texier/enzyras.htm

http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/chimdata/scripts/cpa.htm

http://www.ac-orleans-tours.fr/svt/theme4/mol/pcdefault.htm

Hb / Rastop : forme d'une protéine : structure I, II, III, IV

tableau : on peut décrire un protide à plusieurs niveaux ou échelle :

structure primaire

secondaire

tertiaire

quaternaire

polymérisation d'acides aminés

configuration spatiale simple

configuration spatiale complexe

assemblage de sous-unités

polypeptide

hélices, feuillets, boucles

protéine

complexe protéique

La configuration spatiale (structure secondaire, hélices, feuillets, boucles) d'une protéine est déterminée par la séquence des acides aminés (structure primaire, polypeptide, liaison peptidique) qui la constituent. La fonction d'une protéine dépend de sa structure.

 

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