Les enzymes sont des protéines : qu'est-ce qu'une protéine ?
éléctrophorèse des protéines du blanc d'oeuf (manuel p.78) : http://www.didier-pol.net/2elec-pr2.htm
electrophorese : http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/doc_biochemistry-electrophoresis.htm
séparation des acides aminés par chromatographie d'une protéine hydrolysée par protéase : http://www.didier-pol.net/2FTCCMAA.html
formule chimique des acides aminés puis de la liaison peptidique : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/acideamine/acideamine.htm
modélisation des acides aminés puis de la liaison peptidique
les protéines, phénotype moléculaire, sont formées d'acides aminés, reliés par liaison peptidique. Les protéines sont des polymères d'acides aminés, donc des polypeptides, formant une séquence d'acides aminés. Il existe 20 acides aminés différents.
Alors y'é réprend la molécoule vue avec les enzymes, une enzyme donc :
modélisations carboxypeptidase : fichiers Rastop : CPA.PDB et CPA-SUB.PDB (site actif)
forme globale : Ruban -> hélices et feuillets
avec plugin Chime : http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/chimdata/scripts/cpa/cadr_cpa.htm
http://www.ac-poitiers.fr/svt/activite/texier/enzyras.htm
http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/chimdata/scripts/cpa.htm
http://www.ac-orleans-tours.fr/svt/theme4/mol/pcdefault.htm
Hb / Rastop : forme d'une protéine : structure I, II, III, IV
tableau : on peut décrire un protide à plusieurs niveaux ou échelle :
|
structure primaire |
secondaire |
tertiaire |
quaternaire |
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|
polymérisation d'acides aminés |
configuration spatiale simple |
configuration spatiale complexe |
assemblage de sous-unités |
|
polypeptide |
hélices, feuillets, boucles |
protéine |
complexe protéique |
La configuration spatiale (structure secondaire, hélices, feuillets, boucles) d'une protéine est déterminée par la séquence des acides aminés (structure primaire, polypeptide, liaison peptidique) qui la constituent. La fonction d'une protéine dépend de sa structure.