L'initiation DE LA TRADUCTION.

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Sur le mARN, il existe près de l'extrémité 5' phosphate un codon initiateur. Ce codon est presque toujours AUG, il code pour la méthionine. Ceci signifie que toutes les chaînes polypeptidiques commencent par de la méthionine. Ce codon initiateur se rencontre aussi bien chez les procaryotes que chez les eucaryotes. Cependant, chez les procaryotes, cet acide aminé est modifié car il ne possède pas de fonction -NH2 (ou NH3+) libre. Cette fonction est bloquée par l'acide formique (HCOOH) d'où le nom de formylméthionine donné à ce premier acide aminé (en abrégé fMet). Cet acide aminé peut dans un deuxième temps être enlevé de la chaîne polypeptidique. L'initiation de la traduction nécessite la reconnaissance du codon AUG (codon initiateur). Il est important de souligner que pour insérer des résidus de méthionine à l'intérieur d'une chaine polypeptidique, l'ARN de transfert est différent, bien que le codon reconnu (AUG) soit le même que le codon initiateur.

Chez les procaryotes, le mARN forme un complexe positionné par l'appariement entre une séquence située en 5' du codon d'initiation AUG et à moins de 10 bases de celui-ci et l'extrémité 3' de l'ARN ribosomique 16 S de la petite sous-unité 30 S. Cet appariement permet donc la liaison entre le ribosome (par sa petite sous-unité 30 S) et le mARN. Cette séquence 5'- AGGAGG -3' présente sur les mARN des procaryotes est appelée séquence de SHINE-DALGARNO. Elle est absente des mARN des eucaryotes.

Chez les eucaryotes, en 5' du codon initiateur en règle AUG (codant pour la méthionine), il existe une séquence retrouvée dans de nombreux mARN de vertébrés appelée séquence consensus de KOZAK: CCA/GCCAUGG. Cette séquence facilite l'association entre la petite sous-unité du ribosome et le mARN. Cette séquence consensus comporte le premier AUG, qui est le codon le codon initiateur le plus fréquent chez les eucaryotes.
Ainsi, au début de l'initiation de la traduction, les deux sous-unités 30 S et 50 S du ribosome sont dissociées. Puis, la petite sous-unité 30 S forme un complexe avec le mARN au niveau du codon initiateur et le tARN portant la formylméthionine initiale (tARN initiateur). La grande sous-unité 50 S va alors s'ajouter à cet ensemble. Le ribosome 70 S est alors complet. Les ribosomes possèdent deux sites pour fixer les ARN de transfert:

- Un site A (A pour acide aminé: site acide aminé). Sur ce site, le tARN porteur de l'acide aminé viendra se fixer.

- Un site P (P pour peptide) ou site peptidique pour le tARN porteur de la chaîne peptidique en cours d'élongation.

Initialement, la formylméthionine est fixée dans le site peptidique P par son tARN.