Bioooo2/ DU GÉNOTYPE AU PHÉNOTYPE, RELATIONS AVEC L’ENVIRONNEMENT

2,2/ Les enzymes : Des protéines actives dans la catalyse

2,2,1/ Catalyseurs biologiques

TP enzymologie

hydrolyse amidon par HCl : http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/index8.html

hydrolyse amidon par maxilase : http://www.didiersvt.com/cd_1s/html/index8.html

amidon -----------> glucose : réaction très lente.

Accélérée en présence de HCl, encore plus avec maxilase (= amylase)

les noms terminant par « ase » désignent des enzymes et ce qui précède désigne leur substrat (= réactif = molécule sur laquelle l'enzyme agit)

ex : amylase, saccharase, lipase, protéase

Les enzymes sont des catalyseurs biologiques : elles accélèrent la réaction sans être transformées (catalyseur), elles sont produites par les êtres vivants (bio)

TP ExAO catalase

TP pepsine sur ovalbumine

TP peroxydase du raifort (radis noir)

2,2,2/ Double spécificité enzymatique

TP enzymologie

comparaison activités amylase // saccharase

spécificité de substrat

synthèse d'amidon : http://www2.ac-lyon.fr/enseigne/biologie/ress/enzymo/enz_pdt.html

comparaison activités amylase // amidon synth(ét)ase

spécificité d'action, anabolique ou catabolique

Les enzymes présentent une double spécificité d'action et de substrat : un seul type d'action sur un seul type de substrat. Les actions peuvent être ana ou cataboliques (synthèse ou dégradation). Donc le métabolisme d'une cellule dépend de son équipement enzymatique.

2,2,3/ Mode d'action des enzymes

modélisations carboxypeptidase : fichiers Rastop : CPA.PDB et CPA-SUB.PDB (site actif)

forme globale : Ruban -> hélices et feuillets

site actif : Ctrl M -> "restrict within(6.0,gly1)"

voir toute la mol : Ctrl W

avec plugin Chime : http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/chimdata/scripts/cpa/cadr_cpa.htm

http://www.ac-poitiers.fr/svt/activite/texier/enzyras.htm

http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/chimdata/scripts/cpa.htm

http://www.ac-orleans-tours.fr/svt/theme4/mol/pcdefault.htm

http://www.ac-corse.fr/SVT/bonnet2.htm

Le mode d'action des enzymes est lié à la structure spatiale de la molécule (protéine) : la double spécificité (d'action et de substrat) repose sur la forme du site actif qui permet la formation du complexe enzyme-substrat et ainsi la catalyse de la réaction. La forme du site actif de l'enzyme dépend de la séquence polypeptidique (en acides aminés) qui la compose.