ÉTUDE DE LA PHÉNYLCÉTONURIE SUR UNE BANQUE DE SÉQUENCES
La phénylalanine est un acide aminé normalement transformé en tyrosine par une enzyme, la PAH. Chez les individus atteints de phénylcétonurie la PAH n'est pas fonctionnelle. La phénylalanine qui s'accumule est dégradée en composé cétonique : l'acide phénylpyruvique. La phénylalanine et l'acide phénylpyruvique sont toxiques à forte concentration, ils provoquent des troubles digestifs, des lésions cutanées et un retard mental important caractéristiques d'une maladie : la phénylcétonurie. Le test de Guthrie permet de détecter les taux élevés de phénylalanine chez les nouveaux-nés. Même si l'excès est toxique, on ne peut supprimer totalement cet acide aminé car il est indispensable à la croissance de l'enfant. Lorsque le test est positif, l'enfant est soumis à un régime alimentaire strict appauvri en phénylalanine ce qui limite, voire annule, les effets de la maladie.
Phénotypes :
différents niveaux de phénotypes :
macroscopique : troubles digestifs, lésions cutanées et retard mental important
microscopique : cytotoxicité
moléculaire : PAH non fonctionnelle:
=> excés de Phe => phénylcétone toxique dans le sang et l'urine,
=> manque de Tyr => de Mélanine => pâleurs
Génotypes : Le tableau suivant donne l'activité de la PAH (PhénylAlanineHydroxylase) en % par rapport à l'activité normale, selon les allèles présents.
Homozygote : [identique ; oeuf] se dit d'une cellule qui possède deux allèles identiques pour un gène, opposé de hétérozygote
individus homozygotes :
|
allèles |
phe7 |
phe11 |
phe4 |
phe9 |
phe17 |
|
phe7 |
0 |
1,5 |
5 |
15 |
25 |
|
phe11 |
1,5 |
3 |
6,5 |
16,5 |
26,5 |
|
phe4 |
5 |
6,5 |
10 |
20 |
30 |
|
phe9 |
15 |
16,5 |
20 |
30 |
40 |
|
phe17 |
25 |
26,5 |
30 |
40 |
50 |
Allèles : Il existe plus de 20 allèles de ce gène. Remplir le tableau suivant grâce à la banque de séquences Anagène. Attention : les séquences « .cod » d'Anagène correspondent au brin codant = non transcrit
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Allèle |
ADN transcrit : nucléotides |
ARNm : codons |
Protéine : acides aminés |
Type de mutation |
homozygote |
|
phenorm |
Référence |
Référence |
Référence |
Ø |
Sain |
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phe1 |
A 165 Ø |
UUU 55 UUG |
Phe 55 Leu |
Délétion décalante |
Sévère |
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phe2 |
TAG 283-285Ø |
AUC 95 Ø |
Ile 95 Ø |
Délétion non décalante |
Peu sévère |
|
phe3 |
G 331 A |
CGA 111 UGA |
Arg 111 STOP |
Substitution non sens |
Sévère |
|
phe4 |
C 473 T |
CGG 158 CAG |
Arg 158 Gln |
Substitution faux sens |
Assez sévère |
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phe5 |
CT 663+664 Ø |
GAU 222 UAA |
Asp 222 Ø |
Délétion décalante |
Sévère |
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phe6 |
C 696 T |
CAA 232 CAG |
Gln 232 Gln |
Substitution neutre |
Sain |
|
phe7 |
G 727 A |
CGA 243 UGA |
Arg 243 STOP |
Substitution décalante |
Sévère |
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Phe8 |
C 735 T |
GUG 245 GUA |
Val 245 Val |
Substitution neutre |
Sain |
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phe9 |
C 782 T |
CGA 261 CAA |
Arg 261 Gln |
Substitution non sens |
Peu sévère |
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phe10 |
C 814 A |
CGA 272 UGA |
Gly 272 Ø |
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Sévère |
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phe11 |
C 838 T |
GAA 280 AAA |
Glu 280 Lys |
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Sévère |
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phe12 |
A 896 G |
UUU 299 UGU |
Phe 299 Cys |
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Sévère |
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phe13 |
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phe14 |
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phe15 |
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phe16 |
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phe17 |
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