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Par trichard le 18 Janvier 2013 à 10:19
A3/ Comparaison de gènes sur banque de séquences / logiciel anagène
Protocole / Manuel p 64
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drépanocytose : fichier → thèmes d'étude → relation pheno-génotype → phénotype drépanocytaire → comparer les séquences → comparaison simple → noter les différences
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albinisme : fichier → banque de séquences → tyrosinase → tyrcod1 & tyralba1 → comparer → comparaison simple → noter les différences
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groupes sanguins : fichier → banque de séquences → système ABO des groupes sanguins
Charger des séquences - « acod.adn », « bcod.adn » et « ocod.adn » sont les allèles du gène des groupes sanguins [« .cod.adn » = ADN, « .pro » = protéine]
Comparer (alignement avec discontinuité) - combien de bases (nucléotides) en commun ? Différents ?
gène, allèles, génotype
A4/ Comparaison d'allèles phénylcétonuriques / Anagène
© J:\1S COURS\1S_TP_phénylcétonurie_anagene.odt
Anagène → fichier → banque de séquences → la phenylalanine hydroxylase
remplir la première colonne du tableau (attention avec bases complémentaires)
rôle de l'alimentation sur le génotype
allèle, géne, génotype, homo/hétérozygote
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Par trichard le 15 Janvier 2013 à 13:51
A2/ Protéine thermomètre chez Arabidopsis thaliana / article PrLaSce
© J:\1S COURS\protéine thermomètre plantes.odt : http://www.pourlascience.fr/ewb_pages/a/actualite-une-proteine-thermometre-chez-les-plantes-24153.php
rappel : http://youtu.be/eYrQ0EhVCYA (couper son sans rapport)
FT/ Logiciels de traitement de séquences moléculaires
banques de séquences : Seqaid → Anagene
SEQAID : http://www.inrp.fr/Acces/biogeo//genemol/seqaid.htm ; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC321006/
ANAGENE : http://www2.cndp.fr/svt/anagene/accueil.htm ; http://acces.ens-lyon.fr/evolution/logiciels/anagene/passer-a-anagene2
FT fournies au TP de Bac (ECE) : http://pedagogie.ac-toulouse.fr/svt/serveur/bankact/index.php?m=1&sm=1
= bases de données de séquences moléculaires
B222/ Gènes et environnement
L’ensemble des protéines qui se trouvent dans une cellule (phénotype moléculaire) dépend :
- du patrimoine génétique de la cellule (une mutation allélique peut être à l’origine d’une protéine différente ou de l’absence d’une protéine) ;
- de la nature des gènes qui s’expriment sous l’effet de l’influence de facteurs internes et externes variés.
Mots clefs : facteurs d'expression, variabilité
glossaire : http://www.nature.ca/genome/02/022_f.cfm
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Par trichard le 14 Janvier 2013 à 11:05
§ des pelages pas tous génétiques
D:\1S COURS\gene-rayures2.2.odp
§ Génétique ou environnement ? Nature ou culture ? Inné ou acquis ?
222/ Gènes et environnement
A1/ Exercices sur lapins himalayens / documents
J:\1S COURS\gene_lapin_himmalaya.odp
J:\1S COURS\gene_lapin-himmalaya.odt
http://lewebpedagogique.com/chezmoiplusdesvt/files/2008/02/exercice-lapin-himalayen.doc
http://svt.ac-dijon.fr/schemassvt/article.php3?id_article=424
http://svtndgautier.free.fr/ps/geno/lapinhima.pdf
rôles de l’environnement et du génotype dans l’expression d’un phénotype.
C/ poursuivre / quelques articles colorés
Mécanismes génétiques de la couleur des yeux : http://www.techno-science.net/?onglet=news&news=4116
Génétique de la couleur et de la texture du pelage chez le chat domestique : http://www.academie-veterinaire-defrance.org/fileadmin/user_upload/Bulletin/pdf/2012/numero_3/205.pdf
Trois gènes pour des chiens de tous poils : http://sciencesetavenir.nouvelobs.com/nature-environnement/20090828.OBS9152/trois-genes-pour-des-chiens-de-tous-poils.html
Mélanisme et évolution chez la souris pocketmice : http://www.svt-hatier.com/ressources/chap_4/svt2_c4_app.pdf
The genetic basis of adaptive melanism in pocket mice : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC154334/#_blank
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Par trichard le 11 Janvier 2013 à 10:03
A5/ Détermination d'un phenotype moléculaire / électrophorèse
TP_drepanocytose_electrophorese.doc
http://www.snv.jussieu.fr/bmedia/ATP/bioch5.htm
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Par trichard le 8 Janvier 2013 à 14:00
A2/ Cas des groupes sanguins / manuel p67
Règles immunologiques de la transfusion sanguine : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/gpes-sanguins/04regles.htm
hématies marquées : A, B et/ou O = antigène
génotypes : (A//A) ou (A//O) ; (B//B) ou (B//O) ; (A//B) ; (O//O)
phénotypes : [A] ; [B] ; [AB] ; [O]
molécule protéique à la surface des cellules
au niveau micro et moléculaire : http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/gpes-sanguins/index.htm
(génotype) => [phénotype]
A3/ Cas de la drépanocytose / manuel p62 à 65
Diap drepanocytose
différentes échelles d’un phénotype : mol, micro, macroscopique,
A4/ Cas d'Arabidopsis thaliana / www
Phénotype mol, micro, macroscopique,
facteurs d'expression, variabilité
B221/ Du génotype au phénotype
Le phénotype macroscopique dépend du phénotype cellulaire = microscopique, lui-même induit par le phénotype moléculaire = protéine. Le phénotype moléculaire est gouverné par le génotype. Le génotype est la composition allélique d'une cellule pour un gène donné. Le phenotype est l'expression du génotype.
Mots clefs : Phénotype moléculaire, microscopique, macroscopique, expression génétique, protéine,
lexique : http://www.premiumwanadoo.com/renard/revisions/SVT/lexBio.htm
pour le TP de jeudi faire une FT / électrophorèse / manuel p.396
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